B2C电商建站与B2B2C电商系统搭建在本质上的不同主要体现在以下几个方面：

1. 使用对象和交易模式B2C电商建站主要面向个人消费者，是企业直接向消费者销售产品或服务的平台。而B2B2C电商系统则涉及供应商、电商平台和消费者三方，形成一个多方参与、互惠互利的生态系统。B2B2C模式中，供应商提供商品或服务，平台负责搭建交易环境，消费者进行购买，三方共同完成交易。

2. 核心业务功能B2C电商建站的核心功能主要包括商品展示、订单管理、支付结算等，专注于零售业务的直接销售。而B2B2C电商系统在B2C功能的基础上，增加了供应链管理、订单协同、多级分销等功能，以支持更复杂的商业流程和多方协作。

3. 系统复杂度和开发难度B2C电商建站的技术实现相对成熟，市场上已有许多成熟的电商解决方案可供选择。而B2B2C电商系统则需要根据企业需求进行定制开发，涉及多方参与和复杂的业务逻辑，技术实现难度更高。

4. 商业模式和盈利模式B2C电商建站的商业模式主要依靠流量获取收益，企业通过吸引消费者增加销售额，实现盈利。而B2B2C电商系统的盈利模式更加多元化，可以通过供应商入驻费、交易佣金、增值服务等多种方式实现盈利。

综上所述，B2C电商建站与B2B2C电商系统在本质上的区别主要体现在使用对象、交易模式、核心业务功能、系统复杂度和商业模式等方面。企业在选择合适的电商模式时，应根据自身业务需求和资源条件进行综合考量。