网站结构通过影响关键词的分布和密度，直接作用于词频问题的解决。合理的网站层次结构，如清晰的目录和导航，有助于搜索引擎更好地理解网站主题和内容，从而优化关键词的抓取和索引。

在内容组织方面，将相关内容聚类并形成主题区域，不仅能提升用户体验，还能使搜索引擎更容易识别和索引这些内容。这种结构化的内容布局有助于提高关键词的密度和相关性，进而影响页面在搜索结果中的排名。

内部链接的使用也是网站结构优化的重要手段。通过描述性关键词作为锚文本的内部链接，可以增强关键词的上下文相关性，同时改善用户导航体验。这种结构有助于搜索引擎更有效地抓取和传播关键词，从而提升词频统计的准确性。

此外，现代搜索引擎已能理解词语的上下文和语义关系。因此，网站结构应支持语义丰富的内容组织，避免关键词堆砌和过度优化，确保内容自然且易于理解。这种结构化的内容呈现方式，有助于搜索引擎更准确地评估词频，从而提升网站的整体SEO效果。

而言，网站结构通过优化导航、内链、URL等技术细节，直接影响搜索引擎对关键词的抓取、索引及权重分配。合理的结构不仅能提升用户体验，还能增强关键词的相关性和密度，最终优化词频问题的解决，形成技术优化与内容价值的双重正向循环。