修改网站制作合同条款以减少潜在纠纷，可以从以下几个方面入手：

1. 明确项目范围和需求

在合同中详细列出项目需求、功能规格、设计要求等内容，避免模糊不清的描述。可以采用附件形式详细说明，确保双方对项目范围有共同的理解。

2. 细化双方权利义务

明确甲乙双方在项目中的责任和义务，包括素材提供时间、设计修改次数、验收标准等。例如：“甲方需在合同签订后3日内提供完整素材，乙方需在收到素材后5日内完成初稿，甲方有权提出不超过3次的修改意见。”

3. 制定合理的违约条款

设定清晰的违约责任和赔偿标准，避免因一方违约导致项目延误或成本增加。例如：“若乙方延迟交付项目超过5天，需支付合同金额10%的违约金；若设计质量不达标，乙方需无条件重新设计直至符合要求。”

4. 引入第三方监理机制

在合同中约定引入第三方监理机构，对项目进度、质量进行全程监督。例如：“双方同意聘请第三方监理机构对项目进行全程监督，监理机构将根据合同约定对项目各环节进行审核，并及时向双方反馈问题。”

5. 规范变更流程

明确项目变更的申请、审批、执行流程及相应费用。例如：“任何一方提出变更需求，需提前书面通知对方，经双方协商一致后方可执行，变更费用按实际工作量重新核算。”

6. 约定争议解决方式

明确合同争议的解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼，并约定管辖法院或仲裁机构。例如：“双方在履行合同过程中发生争议，应 通过友好协商解决；协商不成的，提交北京市仲裁委员会仲裁。”

7. 补充保密条款

约定双方对项目相关信息的保密义务，违约方需承担相应法律责任。例如：“双方应对项目过程中知悉的对方商业秘密承担保密义务，未经对方书面同意，不得向任何第三方泄露。”

通过以上条款的完善，可以有效减少合同履行过程中的模糊地带，明确双方责任，降低纠纷风险，构建和谐的合作关系。