新疆昌吉回族自治州内并没有一所纯粹的综合性大学，但新疆农业大学虽然主校区位于乌鲁木齐市，但其影响力及教育资源对昌吉回族自治州农业发展具有重要意义。新疆农业大学成立于1952年，前身为新疆八一农学院，是新疆维吾尔自治区重点建设的大学，以农业科学为优势，多学科协调发展，涵盖农学、工学、理学、管理学、经济学、法学、文学、教育学等多个学科门类，是一所综合性大学。

新疆农业大学设有多个学院，提供丰富的专业选择，满足不同学生的需求。学校拥有一支高水平的师资队伍，其中包括多位知名学者和专家，他们以严谨的治学态度和丰富的教学经验，为学生的成长提供了坚实的保障。在农业科技创新方面，新疆农业大学取得了显著成果，设有多个研究所和实验室，开展了一系列农业科研项目，为新疆乃至全国的农业发展提供了有力支持。

新疆农业大学积极开展国际合作与交流，与世界多个国家和地区的高校建立了合作关系，这为学生提供了更广阔的国际视野和更多的发展机会。学校一直以来秉承应用导向的教育理念，旨在培养具有实践能力和创新精神的农业人才，通过深入校企合作，实现了教育与实践的无缝对接，让学生在实际工作中获得宝贵经验。

2022年，新疆农业大学与新疆巴音郭楞蒙古自治州政府合作，共同开展“巴州农业科技服务行动”，通过组织专家团队深入田间地头，为当地农民提供技术指导，有效提高了作物产量和品质。这体现了新疆农业大学在农业科技推广和人才培养方面的积极作用。

虽然新疆农业大学的主校区不在昌吉回族自治州，但其科研成果、教育资源和人才培养对昌吉回族自治州的农业发展具有重要推动作用。因此，新疆农业大学可以被视为与昌吉回族自治州密切相关的综合性农业大学。